Ранее частью 5 статьи 2 Федерального закона "Об автономных учреждениях" предусматривалось, что собственник имущества автономного учреждения не несет ответственность по обязательствам автономного учреждения. Вместе с тем, в пункте 6 статьи 123.22 ГК РФ закреплено, что по обязательствам автономного учреждения, связанным с причинением вреда гражданам, при недостаточности имущества учреждения, на которое может быть обращено взыскание, субсидиарную ответственность несет собственник имущества автономного учреждения. В целях устранения существующих противоречий новой редакцией части 5 статьи 2 Федерального закона "Об автономных учреждениях" установлено, что собственник имущества автономного учреждения несет субсидиарную ответственность по обязательствам автономного учреждения в случаях, предусмотренных Гражданским кодексом РФ.